Да, ты можешь. Но вы, вероятно, не должны.
Корпус защищает ваш жесткий диск от механического и электрического воздействия. Я бы не использовал внешний жесткий диск без какой-либо защиты. Если вы можете найти корпус только для eSATA, я сомневаюсь, что в нем будет какая-либо активная электроника, поскольку SATA и eSATA одинаковы на электрическом уровне.
Некоторые материнские платы поставляются с кронштейном eSATA, который по сути является кабелем eSATA-female-SATA-male. С помощью этого кабеля вы можете попробовать создать какой-нибудь корпус для самостоятельного изготовления (вам необходимо отдельно подавать питание на жесткий диск).