Почему мой новый компьютер на 40% медленнее вычисляет и записывает поверхность сетки?

Question

Я только что обновил компьютер, чтобы быстрее выполнять научные расчеты. В центре внимания изменений было шагнуть до Nvidia 1080Ti от 980Ti.

Сейчас я запускаю тестовую модель. Я получаю следующие результаты:

Stage             1080Ti PC    980Ti PC  
Set up            00:00:12     00:00:14  
Create grid       00:22:25     00:15:50  
GPU calc          00:02:24     00:03:25  
Export results    00:00:22     00:00:26

Итак, вы можете видеть выше, что все быстрее, кроме создания сетки. Этап графического процессора на 30% быстрее с 1080Ti, чем с 980Ti, что здорово, а экспорт на 15% быстрее. Но создание сетки на 40% медленнее.

Я думаю, что шаг сетки в основном зависит от процессора и жесткого диска. Поэтому я сделал наборы тестов CPU и HDD для Phoronix Test Suite. Было установлено, что процессор i7-7700k лучше, чем i7-4790, во всех 14 тестах, которые я проводил. Но когда я проводил тестирование жестких дисков, твердотельный накопитель Samsung 960 EVO NVMe был в основном лучше, чем твердотельный накопитель Samsung 850, за исключением нескольких тестов, в частности, отметка dBench 1 Client была на 40% хуже, а отметка SQLite Insertions была на 80% хуже. Сравнение производительности HDD Итак, я предполагаю, что проблема связана с жестким диском.

Итак, мои вопросы:

1. Как вы думаете, жесткий диск Samsung 960 EVO привел к снижению производительности на 40% по сравнению с твердотельным накопителем Samsung 850?
2. Есть ли у вас какие-либо предложения о том, как это исправить?

Answer 1

Кредит на этот ответ идет на мой местный техник MSY. Он увидел эту статью: http://www.pcworld.com/article/3173618/linux/kaby-lake-is-unleashed-with-kernel-410.html и заставил его задуматься, ограничивает ли ядро 4.4 linux NVMe 960 EVO HDD как-то. Поэтому я обновил ядро с версии 4.4 до версии 4.10, и без каких-либо других изменений производительность шага сетки увеличилась на 39%. В качестве бонуса производительность шага вычисления на GPU увеличилась на 3%.

Stage             1080Ti PC    1080Ti PC    980Ti PC  
                  kernel 4.10  kernel 4.4   kernel 4.4  
Set up            00:00:12     00:00:12     00:00:14  
Create grid       00:13:45     00:22:25     00:15:50  
GPU calc          00:02:20     00:02:24     00:03:25  
Export results    00:00:22     00:00:22     00:00:26

Это не подтверждает наверняка, что причиной проблемы был SSD 960 EVO NVMe. Но это, по крайней мере, приводит систему к тому, что она быстрее, чем старая для этой задачи.