Не существует идеального решения для всех ситуаций. "Лучший" варьируется в зависимости от ваших требований.
Я использую NTFS на нескольких жестких дисках USB емкостью 1 ТБ для широкой поддержки, которую он имеет на нескольких устройствах, потому что я часто беру их с собой к клиентам и знаю, что файлы будут доступны независимо от операционной системы, и в большинстве случаев не требуется никаких дополнительных настроек. ,
Точно так же NTFS поддерживается практически всеми медиацентрами и игровыми приставками, поэтому, если я захочу воспроизвести фильм на устройстве, не подключенном к сети, я, скорее всего, получу доступ к этим жестким дискам.
NTFS также достаточно хороша для восстановления данных, хотя бы потому, что широко используется - многие программные пакеты существуют специально для восстановления "потерянной папки" в разделе NTFS.
Однако если бы я лично планировал разделить 3 ТБ данных между несколькими операционными системами, я бы получил NAS, а не устройство, подключенное через USB - за небольшую дополнительную плату у меня было бы гораздо больше гибкости, безопасности и спокойствия. Например, вы можете отформатировать его как ext4 или что-то более современное с высокой производительностью и смонтировать его как общий ресурс Samba на Windows и Mac, что исключит любые конфликты файловой системы и требования к проприетарному программному обеспечению, например Paragon NTFS.
Учитывая, что NAS будет подключаться к источнику питания большую часть времени, стационарно в одном чистом, сухом месте и управляться с помощью собственной прошивки, он будет гораздо более надежным, чем портативный жесткий диск, который постоянно вращается и записывается и записывается различными различными драйверами и ядрами.
Как примечание, я подозреваю, что проблема, с которой вы столкнулись, менее вероятно будет вызвана сбоем NTFS или Windows, но встроенным программным обеспечением на самом диске или даже физическим отказом самого диска. Я бы порекомендовал сделать резервную копию любых данных, которые вас интересуют.
Подводя итог моему скучному ответу, я думаю, что если вы планируете продолжать использовать портативный жесткий диск и регулярно подключать его к нескольким компьютерам, то вы отдаете предпочтение удобству, и NTFS уже является вашим лучшим выбором.
Однако, если вы решите, что больше заботитесь о надежности и безопасности данных, чем о переносимости, я бы посоветовал вообще не использовать портативный накопитель и получить NAS, который будет использоваться всеми тремя операционными системами и / или любыми другими устройствами в вашем доме с помощью Samba.