В настоящее время у меня установлено 5 дисков SATA и установлена ОС Windows 7.
Я хочу изменить порядок соединений, т.е. подключить все диски к различным портам. Это что-то портит в окнах?
Вы имеете в виду физически подключить их к разным портам на материнской плате? Это должно быть хорошо, просто обратите внимание, что вы, возможно, захотите войти в BIOS после внесения изменений и подтвердить, что диски и порядок загрузки соответствуют вашим требованиям.