К сожалению, нет никакой возможности предотвратить это глобально.
Но есть способ отключить автоматический перезапуск после обновления Windows (как минимум).
Перейдите в Run и введите: gpedit.msc
Теперь перейдите по ссылке: Политика локального компьютера> Конфигурация компьютера> Административные шаблоны> Компоненты Windows> Центр обновления Windows> Без автоматического перезапуска с вошедшими в систему пользователями запланированной автоматической установки обновлений
И, может быть, вы также можете отключить режим "сна", это тоже неприятно (на мой взгляд).
Go to Start->Control Panel->Power Options
Select **Change when the computer sleeps**
Choose **Never** and Save changes