Так что это решение, вероятно, слишком специфично и слишком сложно для большинства пользователей, но тем не менее оно решило мою проблему.
Первая часть включала добавление Закладки с именем "FileName", где я хотел получить свой идентификатор.  Следующий макрос обновляет Закладку до имени файла при открытии документа:
Private Sub Document_Open()
'
' Document_Open Macro
'
'
    Application.OnTime (Now + TimeValue("00:00:02")), "ProcessActiveDocument"
End Sub
Sub ProcessActiveDocument()
    Dim BmkNm As String, BmkRng As Range, FileName As String
    BmkNm = "FileName"
    FileName = ActiveDocument.Name
    If InStrRev(FileName, ".") > 0 Then FileName = Left(FileName, InStrRev(FileName, ".") - 1)
    If ActiveDocument.Bookmarks.Exists(BmkNm) Then
      Set BmkRng = ActiveDocument.Bookmarks(BmkNm).Range
      If BmkRng.Text = FileName Then Exit Sub
      BmkRng.Text = FileName
      ActiveDocument.Bookmarks.Add BmkNm, BmkRng
    Else
      MsgBox "Bookmark: " & BmkNm & " not found."
    End If
    Set BmkRng = Nothing
End Sub
Конечно, безопасность макросов должна быть правильно отключена, чтобы это работало.
Следующая часть была скриптом Python для дублирования файлов и открытия каждого запускающего макроса.
import os
import shutil
ref_dir_base = "C:/SN"
word_doc = 'SN-'
word_ext = '.doc'
ref_num = 1
ref_str = str(1000+ref_num)[1:]
begin_num = 2
stop_num = 12
word_exec = '\"C:/Program Files (x86)/Microsoft Office/Office14/Winword.exe\"'
for i in range(begin_num, stop_num+1):
    num_str = str(1000+i)[1:]
    shutil.copytree(ref_dir_base+ref_str, ref_dir_base+num_str)
    old_doc_name = word_doc + str(ref_num) + word_ext
    new_doc_name = word_doc + str(i) + word_ext
    new_path = ref_dir_base + num_str + os.altsep
    os.rename(new_path + old_doc_name, new_path + new_doc_name)
for i in range(begin_num, stop_num+1):
    num_str = str(1000+i)[1:]   
    new_doc_name = word_doc + str(i) + word_ext
    new_path = ref_dir_base + num_str + os.altsep
    exec_param = '\"'+new_path+new_doc_name + '\"'
    exec_str = '\"'+word_exec+' '+exec_param +'\"'
    os.startfile(exec_param)
Единственная проблема этого подхода заключается в том, что документ Word остается открытым и несохраненным, поэтому пользователю необходимо сохранить документ, чтобы изменения вступили в силу.