Два я могу придумать; Скорость и устойчивость к ошибкам.
Доступ через смонтированный виртуальный диск ISO неизбежно будет медленнее, чем прямой доступ к файлам. Для открытия отдельных фотографий в программе просмотра, вероятно, это будет незаметно.
Что касается ошибок, то любое повреждение файла ISO может сделать весь лот недоступным. Конечно, большинство ошибок на жестком диске будет гораздо серьезнее, чем небольшие, не подлежащие восстановлению поврежденные данные, но, допустим, вы получили небольшое количество повреждений на вашем диске.
В случае папок, содержащих отдельные файлы, это приведет к тому, что любые файлы, в которых данные были повреждены, останутся нечитаемыми (недоступными как изображения).
Однако такое же повреждение небольших данных в любом месте файла ISO, скорее всего, сделает весь образ ISO не монтируемым и, следовательно, не читаемым.
Однако, если вы также использовали ISO-образ для записи резервного диска, хранящегося в надежном месте в ящике, то это не имеет значения (и в любом случае маловероятно для современных накопителей).