Просто установите все, что вы можете на свой SSD.
Когда он приближается к заполнению, используйте что-то вроде WinDirStat для определения больших папок (в "Program Files", оставьте ваши папки Windows в покое), переместите их на жесткий диск и используйте соединения NTFS для создания ссылки из старое местоположение на SSD на новое место на вашем жестком диске.
Вероятно, вы могли бы оценить каждое приложение по преимуществам и недостаткам его перемещения, основываясь на доступе к диску и размеру файла, но, откровенно говоря, срок службы, вероятно, слишком короткий, поэтому я просто рассмотрю, как часто вы используете что-то, так как может быть лучше переместить немного меньшая (но менее используемая) папка.