Пока сбой связан с программным обеспечением (например, вы не уронили свою машину с кухонного стола), самому жесткому диску не будет причинено никакого вреда.
Причиной проблем с загрузкой после сбоев является тот факт, что некоторые файлы были повреждены из-за неполной записи. Проще говоря, скажем, ваша машина с Ubuntu выполняла запись в файл конфигурации, который читается во время загрузки, но когда запись была на полпути, произошел сбой. Это приводит к тому, что неполный файл находится на диске, поэтому при следующей загрузке у вас может возникнуть проблема, потому что система не знает, что делать с этими недоделанными данными.
Обратите внимание, что это никоим образом не является физическим повреждением: если сбой был вызван ошибками программного обеспечения (например, BSOD) или кнопками питания или сброса, вероятно, ничего не будет работать неправильно. Проблемы могут вызывать скачки напряжения, например, вызванные отключением шнура питания, ударами освещения или простым падением вашего ноутбука.
Что касается влияния гостевой ОС на хост: до тех пор, пока гость Ubuntu не касается файлов, принадлежащих хосту Windows (через общие папки и т.д.), Эти проблемы будут влиять только на гостя, а не на хост.