Единственная причина, по которой я бы использовал внешний диск, заключается в том, что я планировал взять диск с собой, где или где-то еще требовалась переносимость. Если ваш диск с данными останется с этим компьютером, то я бы пошел, внутренний, точка.
С другой стороны, если вам нужно переместить весь диск с данными, внешний - ваш лучший вариант.
В середине, если вам нужно переместить частичные данные с этого диска, в этом случае (если это не очень большая часть), я бы пошел с внутренним диском, а затем получить меньший внешний диск или же полагаться на сеть / Интернет для обмена данные.
Что касается надежности, внешние диски, как правило, имеют дополнительный фактор риска потери, что-то, что внутренние диски (кроме дисков в ноутбуках), как правило, не сталкиваются; за исключением того, что оба, вообще говоря, одинаково надежны. Кроме того, если вы не используете eSATA в качестве соединения, трудно, если не невозможно, отслеживать состояние SMART на внешнем жестком диске, поэтому вам будет проще без предупреждения об этом (конечно, если вы не контролируете SMART на ваши внутренние диски, это ничего не меняет, но вы должны быть).
Резервное копирование диска, по большей части, полностью не зависит от его внешнего / внутреннего характера. Единственным предостережением здесь является то, что для внешнего диска может потребоваться ручной компонент, если его буква диска / буква устройства изменяется, когда он снова подключается после отключения.