В проводнике Windows нет разделов или политик реестра, которые не позволяют проверять свободное место на диске при выполнении команды копирования или перемещения. Поэтому вы не можете отключить это поведение, оно жестко закодировано. (Источник: уничтожение, а затем перезапуск Проводника с запущенным Process Monitor и проверка всех ключей, которые он считывает из реестра)
Как уже упоминалось выше, Robocopy является потенциальным решением, поскольку оно не проверяется перед началом копирования. XCOPY также является опцией.
Однако, если вы предпочитаете хороший интерфейс файлового менеджера, я собираюсь предложить вам проверить Directory Opus, так как он также не выполняет предварительные проверки перед началом процесса. Вы можете использовать это для объединения ваших файлов, и как только он найдет файл, который уже существует, вы можете сказать ему пропустить все дубликаты. Этот продукт не является бесплатным.