У меня тоже была эта проблема 16.04, но в 18.10 она еще хуже. Я использую Lenovo Thinkpad X1 Carbon 4-го поколения и теряю щелчки мышью в Ubuntu. Когда я открываю Firefox, курсор застревает "позади" Firefox. Щелчок левой кнопкой мыши не делает ничего, кроме щелчка правой кнопкой мыши возвращает курсор назад и внезапно позволяет мне щелкать мышью. То же самое верно для обычных окон гномов, но еще хуже. Я не могу ничего щелкнуть в окнах настроек или в любом другом окне гнома по умолчанию. Я должен щелкнуть правой кнопкой мыши, чтобы сфокусироваться, и тогда иногда щелчок левой кнопкой будет работать, а иногда - нет. Я не могу нажать ни одну из "верхних полос" для этих диалогов. Это свежая установка Ubuntu 18.10. Единственное, что я сделал, это установил gnome. Эта проблема существовала и до Gnome.