Я впервые пользуюсь GROMACS. Согласно этому превосходному учебнику (http://www.mdtutorials.com/gmx/lysozyme/01_pdb2gmx.html), я загрузил файл PDB для лизозима, затем удалил молекулы воды, введенные в следующую команду на CygwinShell (с активированной GROMACS),
$ gmx pdb2gmx -f 1AKI_clean.pdb -o 1AKI_processed.gro -water spce
Однако я получаю сообщение об ошибке:
В параметре командной строки -f файл 1AKI_clean.pdb не завершается или недоступен.
Пожалуйста, совет, где я иду не так Любое понимание будет оценено.Спасибо, Нина