Папка C:\WIndows\Assembly - это глобальный кэш сборок (GAC), используемый в среде выполнения .NET.
Обычно для управления содержимым этой папки рекомендуется использовать команду .NET gacutil ( https://docs.microsoft.com/en-us/dotnet/framework/tools/gacutil-exe-gac-tool).
Однако, если вы думаете, что у него есть пустая папка, вы можете удалить это.
Если вы удалите непустую папку, это может создать проблему для запуска программы на основе .NET на вашем компьютере.
Обратите внимание, что вам понадобятся права администратора для удаления любого содержимого в этой папке. (даже если это пустая папка)