Автозапуск показывает много повторяющихся записей запуска, как вы видите 
В основном это не беспокоит меня. Но, например, выделение розового цвета вызывает «Уже запущено - хотите заменить?"сообщения для дюжины скриптов AutoHotkey, которые он выполняет - что становится утомительным.
Как они возникают и как я могу их исправить, пожалуйста?
(Они оба для «всех пользователей», так что это устраняет одну очевидную причину.)
Для дубликатов AutoHotkey вы можете отредактировать используемые вами скрипты и добавить #SingleInstance, Force , #SingleInstance, Ignore , #SingleInstance, Off и т.д., Чтобы адаптировать эти диалоги при повторном запуске.
Смотрите справку для #SingleInstance .
В этом случае это ленивый обходной путь, при котором не требуется проползать записи реестра, но его также можно использовать для исправления того же, что происходит в других случаях, например, если вы случайно запустили сценарий вручную (и не хотите диалог) или сказать, что вы намеренно хотите, чтобы новый экземпляр заменил старый.
