Как установить PDB2PQR таким образом, чтобы плагин PyMOL для инструментов APBS мог его использовать?

Question

В PyMOL есть плагин под названием инструмент APBS (http://www.pymolwiki.org/index.php/Apbsplugin), который требует трех разных файловых входов:

• Двоичный файл APBS (apbs.exe)
• APBS файл psize.py
• Файл PDB2PQR pdb2pqr.py

Я установил APBS, и в моей папке C:\APBS есть и apbs.exe, и psize.py. Проблема в PDB2PQR, я скачал http://sourceforge.net/projects/pdb2pqr/files/latest/download (версия 2.0.0 для 64-битной Windows) извлек его содержимое и не смог найти какой-либо файл pdb2pqr.py в извлеченном каталог. Я также попытался загрузить tarball pdb2pqr 1.8.0 (.tar.gz) и извлечь его содержимое, как мне сообщили в списке рассылки пользователей PyMOL, что он должен содержать файл pdb2pqr.py и может быть более совместим с PyMOL. Но этот tarball является исходным кодом и должен быть скомпилирован, что невозможно в Windows 7, насколько мне известно.

Answer 1

http://www.poissonboltzmann.org/

Это был бы ваш самый продуктивный способ получить ответ через чат в их раздел технической поддержки и поддержки. Что касается компиляции в Windows 7, то это возможно, если у вас есть ПОЛНЫЙ исходный код и файл процедуры компиляции.

Вы можете столкнуться со сбоем в программном обеспечении из-за того, что Windows 7 НЕ принимает неподписанные драйверы, а также при установке в корневом каталоге, что является плохой идеей, поскольку Win 7, 8 и т.д. Имеют блоки для установки устаревшего типа в корневом каталоге. ,

Лично я хотел бы внести изменения в установку и посмотреть, сможете ли вы установить ее в основной каталог программных файлов или программных файлов x86, если это 32-битное программное обеспечение.

Вы можете счесть необходимым изменить функции безопасности дисков, чтобы разрешить установку. Перед тем как продолжить, прочитайте примечания Microsoft по этому вопросу и дважды проверьте кодирование перед компиляцией. Если это система на базе Linux / Unix-сервера, то двойная установка виртуального сервера Ubuntu может оказаться вам полезной.

Это общая информация, так как я ничего не знаю об использовании или файловой системе, о которой идет речь, и должен восприниматься как совет. Если вы сомневаетесь, обратитесь к производителю и получите помощь всегда будет вашим первым портом захода.