Может или должен?
В правильно спроектированной системе: нет, это не повредит процессор.
В случае более старых ЦП с плохо спроектированными системами, отсутствием охлаждения (например, неисправные вентиляторы, кулеры, полные пыли и плохо работающие, ...), тогда да, это может привести к перегибу. В случае с современными процессорами (где современные - из последнего десятилетия) они не будут повреждены, но будут замедляться. Старые процессоры (например, 486 микросхем) нагреваются до проектных температур и либо выходят из строя, либо сокращают продолжительность жизни.
Но за что-то за последние 10-15 лет: Нет. ЦП построен для выполнения вычислений. Это не наносит вреда при выполнении расчетов. В вашем случае может быть относительно шумно, хотя вентиляторы стремятся утилизировать тепло, но все должно быть хорошо (если шумно).