Установка wubi не требует создания разделов - это главное отличие. Файловая система при установке wubi содержится в одном файле.
Из-за эмуляции файловой системы в файле могут быть различия в производительности и отсутствие некоторых функций, таких как Hibernate.
Ничто не эмулируется (кроме файловой системы, в которой файл монтируется на устройстве цикла) в wubi. Ubuntu имеет полный собственный доступ ко всему вашему оборудованию, в отличие от виртуальной машины, где эмулируется вся система.
Что делает его таким особенным?
Что делает его таким особенным, так это то, что вы можете установить ОС точно так же, как любое другое приложение Windows, попробовать ее, разобраться с ней, поэкспериментировать с ней, а затем, если вы больше не хотите ее использовать, - просто удалить ее.
Напротив, если вы устанавливаете "обычным" способом, есть управление загрузчиком, создание и управление дополнительными разделами, различные типы разделов, а затем попытка удалить их может быть довольно сложной.