Короткий ответ: «Это не должно иметь значения, если это SATA, SCSI, USB, IDE или что-то еще, если вы делаете секторные копии»
Более длинный ответ, на мой взгляд, выходит за рамки этой темы и включает различия в различных типах USB-контроллеров, которые по-разному поддерживают "специальные команды" и т.д.
Кроме того, существует стандарт USB 3.0, который включает SCSI, подключенный через USB, и работает еще лучше с командами и странностями, специфичными для устройства (организация очереди и т.д.).
Любые проблемы, связанные с USB-док-станциями или накопителями, обычно связаны с конкретными командами устройства, и вы обычно сталкиваетесь с ними в таких программах, как hdparm и т.д., А не с dd или ddrescue.
Если вы хотите быть немного более безопасным, вы можете использовать док-станцию USB3 и использовать ее с контроллером USB3.