Вопросы с меткой [portable-batch-system]
PBS; Семейство программного обеспечения для планирования работы, широко используемого на суперкомпьютерах и кластерах.
16 вопросов
3
голоса
2ответа
475 показов
Как я могу заставить режим shell-script в Emacs интерпретировать #PBS -S /bin /bash как код оболочки bash?
Я использую Emacs в системе LINUX, которая использует Portable Batch System (PBS) для управления использованием ресурсов. Сценарии PBS требуют "#PBS -S /bin /..." в качестве первой строки в сценарии, ...
2
голоса
0ответов
4k показов
Работа не работает под Torque, установка Мауи не помогла
Поэтому я только что установил Torque на небольшой кластер, который мы настраиваем, и все, казалось, прошло довольно гладко. У меня pbs_mon работает на вычислительных узлах, а pbs_server - на ...
2
голоса
0ответов
7k показов
libXtst.so.6: невозможно открыть общий объектный файл: нет такого файла или каталога
ОБНОВЛЕНИЕ: после qsub я много раз замечал, что когда имя хоста - opt ###, оно работает, но для других узлов, в которых имя хоста имеет другую топологию int ###, - нет. Я обсуждал это с менеджером ...
2
голоса
2ответа
1k показов
qsub -hold_jid -afterok цикл не запускается
Я пытаюсь запустить серию заданий, переданных в кластер, одно за другим, используя следующий сценарий .sh: Annotation_Loop.sh: #!/bin/bash job=`qsub run_IntersectBed_1.sh 0` for i in {1..3} do ...
2
голоса
1ответ
194 показов
Как сохранить информацию о задании (qstat) в SGE при отправке в qsub?
При отправке задания я могу qsub путь для стандартного вывода и стандартную ошибку. С другой стороны, пока мое задание 12345 выполняется, я могу получить доступ к дополнительной информации, связанной ...
1
голос
1ответ
157 показов
Конфигурирование кластера
Наш кластер представляет собой кластер Linux с Torque и Maui. Я читаю учебники в Интернете и нахожу, что компиляция происходит только на головном узле, и после отправки задания qsub другие узлы ...
1
голос
1ответ
5k показов
установка Grid Engine "не может связаться с qmaster"
Я хочу установить Grid Engine на свой ноутбук. Я использую Ubuntu 11.10 под VirtualBox 4.1.6. (Цель установки Grid Engine - не вычислять что-либо, я просто хочу, чтобы рабочая среда Grid Engine могла ...
1
голос
1ответ
1k показов
Пакетные задания PBS - команда qalter
У меня гигантские вычисления на кластере Scientific Linux. В настоящее время в очереди припарковано более 600 заданий, ожидающих процессорного времени, в то время как некоторые из них уже запущены Я ...
1
голос
1ответ
63 показов
Как узнать время отправки пакетного задания PBS внутри исполняемого скрипта?
Я использую PBS qsub для запуска сценария в кластере, который должен вывести файл отчета с именем, в котором указано время отправки пакетного задания. Время отправки пакетного задания - это время, ...
1
голос
0ответов
74 показов
Сколько памяти используется для определенного процесса
Я использую qsub для отправки работ в кластере (SGE). Я хочу знать, когда я отправляю задание qsub и после его завершения я хочу выяснить, сколько памяти он фактически использует, поэтому в следующий ...
1
голос
1ответ
6k показов
Есть ли способ проверить, сколько заданий у пользователя в очереди?
Я знаю такие команды, как qsub, qstat -a, qstat -an и т.д. Но как я могу узнать, сколько заданий в очереди у одного пользователя (не обязательно обязательно выполняется) в любой момент времени?
0
голосов
2ответа
707 показов
крутящий момент в кластере
Я учусь и у меня есть несколько вопросов об использовании PBS для отправки работ в кластере. (1) Если задание распараллеливается MPI и запускается mpirun без использования qsub, оно может выполняться ...
0
голосов
1ответ
110 показов
Как я могу следовать стандартной ошибке qsub?
Я работаю, используя крутящий момент (qsub). Я хотел бы проследить за стандартной ошибкой задания во время его вывода. Обычные выходные файлы (для stdout и stderr) пишутся только после завершения ...
0
голосов
1ответ
645 показов
PBS/Torque: очень простой скрипт pbsdsh с PBS_VNODENUM
Я пытаюсь отправить следующий очень простой скрипт в мой кластер: #!/bin/sh #PBS -l nodes=3:ppn=8,walltime=00:01:00 #PBS -M eamorr@mydomain.com #PBS -j oe #PBS -m bae #PBS -N geophysics pbsdsh date ...
0
голосов
1ответ
342 показов
Создайте стандартный вывод задания SGE на терминал источника
Я хочу отправить отдельные задания в Sun Grid Engine и сделать так, чтобы они выполнялись локально. Вместо создания файлов stdout и stderr для их вывода на вызывающие терминалы stdout и stderr. ...
0
голосов
0ответов
20 показов
QSUB зависает на одном пользователе в опции X
Я использую PBS для распределения рабочих мест в кластере. Обычно я могу запустить интерактивный режим X11 в узле с помощью: qsub -I -X -l select=1:vnode=gpunode1 но это не работает для нового ...