Автономный R в OS X

Question

Я пытаюсь создать автономную установку R, которую я могу подключить к USB или архиву и поделиться с моими коллегами, которые не хотят беспокоиться об установке R на свой компьютер и все имеющиеся у меня пакеты.

Я провел некоторое исследование и нашел эти посты:

• Развертывание настольных приложений с использованием R (для Windows)
• Модификация R для получения перемещаемого тарбола
• Пусть R и Rscript выводят пути из своего местоположения

Я опробовал решения во 2-м и 3-м постах на своем Ubuntu, выполнив make install в произвольном месте, а затем либо A). Используя sed для редактирования установленного bin/R, как во втором посте, или B). Модификация начала установленного bin/R согласно предложению в третьем посте. В Ubuntu или другом Linux это дает мне папку, содержащую и устанавливающую папки bin, lib и share R, которые должны быть автономными и могут быть перемещены, подключены к USB и на другую коробку Ubuntu.

Я хотел бы добиться аналогичного результата, но для моего Macbook Pro и OS X. Когда вы make install R в пользовательское место с --prefix в OS X, вместо трех папок bin, lib, share, которые вы видите в Linux, там это папка с именем lib, и что-то с именем R.framework. Папка lib содержит папку с именем pkgconfig, содержащую файл с именем libR.pc. R.framework содержит несколько символических ссылок и каталог версий. Этот каталог версий содержит символическую ссылку с именем Current, а затем ряд папок, содержащих различные версии R. Каждая из этих папок версий содержит символическую ссылку с именем Headers, одну с именем PrivateHeaders (содержащую загрузку заголовочных файлов) и одну с именем Resources. Наконец, эта папка Resources содержит папки, такие как bin, etc, share и т.д., Например, исходная папка R.

Я не знаком с этой структурой OS X. Итак, я хотел бы знать, что мне нужно сделать, теперь, когда у меня есть make install ed R в локальной папке на OS X? Я думаю, что в принципе это должно быть похоже на исправление для Linux - редактирование путей в сценарии bin/R R_ROOT_DIR. Тем не менее, я незнаком с этими вещами .framework, в Linux у вас есть локальная папка с тремя каталогами, и пути довольно просто понять и отредактировать.

Любые советы / решения с благодарностью!

Спасибо, Бен.

Answer 1

Кажется, что по крайней мере возможно начать это. После захвата источников R 3.2.1 и разыскивания я сделал следующее:

mkdir localinstall
./configure --prefix=`pwd`/localinstall \
            --without-tcltk \
            --with-cairo \
            --without-aqua \
            --without-x \
            --enable-R-shlib \
            --disable-R-framework

в ванильной системе OS X (через VMware Fusion). Никакой другой установки R не было в системе.

Чтобы он работал с конфигурацией .app , в скрипте bin/R есть переменные окружения, которые вам нужно изменить.

R_HOME_DIR
R_SHARE_DIR
R_INCLUDE_DIR
R_DOC_DIR

Rscript потребует некоторого внимания ( каталог жестко закодирован в этом двоичном файле ), но вы можете настроить его для работы с приложением, если вы получите все другие пакеты поддержки, которые ваше приложение будет использовать без установленной проблемы.