Это то, что я использую:
http://www.bitdefender.com/PRODUCT-80-en--BitDefender-Antivirus-Scanner-for-Unices.html
Лицензия бесплатна на год и может быть продлена, я уже давно пользуюсь ею.
Легко устанавливается на раздел Linux или Unix и легко сканирует ваш смонтированный диск C: или другой носитель, в дополнение к другим двоичным файлам.
ClamAV может делать то же самое, но я думаю, что для простоты и простого сканирования двоичных файлов мне нравится, как Bitdefender справляется с этим, не забывайте, что у вас есть опции для Linux или Unix, вы можете установить оба или просто отказаться и использовать то, что, по вашему мнению, лучше всего работает для ты и твоя среда.