Метод псевдонима, предложенный bender, на самом деле не работает, если вы пытаетесь присоединить его заново, потому что он убивает существующие сеансы. Следующее, кажется, решило проблему для меня:
Сохраните скрипт Perl по адресу http://pastebin.com/nN6zX37K в "~/bin/tmux" или в любом другом месте на вашем пути, перед /usr /bin.
Дайте ему права на выполнение: "chmod +x ~/bin/tmux".
Выйдите и снова откройте Cygwin.
Запустите команды tmux нормально.
Это работает, потому что он обнаруживает состояние, в котором tmux полностью закрылся, но не удаляет свой временный каталог, который он решает, удаляя временный каталог (как предлагает bender), но затем запускает нужную команду.