Почему git для Cygwin всегда путают с правами доступа к файлам? Файл не изменился. TortoiseGIT не считает, что он модифицирован. DOS Git не думает, что он модифицирован.
$ git diff README.md
diff --git a/README.md b/README.md
old mode 100644
new mode 100755
$ ls -l README.md
-rwx------+ 1 Chloe None 824 Sep 4 00:55 README.md
$ which git
/usr/bin/git
$ git --version
git version 1.8.3.4
$ uname -a
CYGWIN_NT-6.2-WOW64 xps 1.7.25(0.270/5/3) 2013-08-31 20:39 i686 Cygwin