При подключении моего телефона Android к моему ноутбуку. Я не думаю, что дело доходит до загрузки жесткого диска, поэтому я не верю, что это актуально, но для полноты картины, это Ubuntu 12.04 с двойной загрузкой и windows 7 с grub.
Основное загрузочное устройство в BIOS: HDD (даже пробовал загрузочную флеш-память, и он, как и ожидалось, загрузил HDD)