Чтобы ответить на мой собственный вопрос:
Fire Fox:
Открыл раздел, который раньше был диском C на Windows, и перешел к: Документы и настройки /(пользователь)/ Данные приложения / Mozilla / Firefox / Профили
Откройте папку профиля в этом и скопируйте ее содержимое (Ctrl + C)
Открыл Firefox. Нажмите Справка, Устранение неполадок, а затем «Открыть папку профиля»
Закройте Firefox и дождитесь его полного завершения, прежде чем открыть папку профиля в Firefox и скопировать содержимое папки профиля из Windows в эту, заменив все файлы
Открыл firefox, и вуаля, все закладки и даже расширения восстановлены.
Гугл Хром:
Для Chrome я только скопировал закладки, а не остальную часть профиля, так как я не хотел терять весь свой кеш / куки в Linux и должен снова войти во все. Может быть возможно скопировать весь профиль так же, как для Firefox выше, но я не проверял это.
Перейдите в Документы и Настройки /(пользователь)/ Локальные настройки / Данные приложения / Google / Chrome / Данные пользователя / По умолчанию
Скопируйте файлы «Закладки» и «Закладки.bak» в буфер обмена.
Перейдите в /home/(user)/.config/google-chrome/Default
Вставьте файл Bookmarks / Bookmarks.bak (это полностью перезапишет ваши резервные копии Google Chrome в Linux с архивами из Windows)
Готово!
Бонус: FileZilla
Перейти к: Документы и настройки / Пользователь / Данные приложения / FileZilla
Скопируйте содержимое в буфер обмена
Перейдите в /home/(user)/.filezilla в Linux
Вставьте содержимое более ранней установки FileZilla из Windows. (Это полностью заменит любые новые сайты / настройки / данные, которые вы добавили в Linux, не делайте этого, если у вас нет ничего в вашей установке FileZilla, чего нет также в установке Windows)
FileZilla теперь имеет все настройки, сайты в менеджере сайтов и т.д., Которые вы создали в Windows.