Даже с SSD загрузка не происходит мгновенно. Это связано с тем, что для загрузки ядра требуется загрузка процессора, время ожидания для обнаружения и инициализации оборудования, проверки конфигураций и т.д. Если бы речь шла только о диске, то Windows полностью загрузилась бы примерно за две секунды.
На ваш вопрос о том, "будет ли хорошей практикой время от времени выполнять полное отключение", я хотел бы отметить, что при перезапуске всегда происходит полное отключение, поэтому, если вы никогда не используете Перезапуск, возможно, вы уже это делаете.
Также обратите внимание, что отключение Hibernate, общего "совета" для Windows 7 по экономии места на диске SSD, также отключает гибридное выключение / быструю загрузку.