Какой самый простой способ собрать группы файлов вместе?

Question

У меня есть файлы с именами этого шаблона:

bond_7.LEU.CA.1.dat
bond_7.LEU.CA.2.dat
bond_7.LEU.CA.3.dat
bond_12.ALA.CB.1.dat
bond_12.ALA.CB.2.dat
bond_12.ALA.CB.3.dat
...

Я хочу объединить все файлы одной группы в один. Например:

cat bond_7.LEU.CA.*.dat > ../bondvalues/bond_7.LEU.CA.1_3.dat

Есть большое количество этих файлов. Как этого добиться с помощью bash-скрипта?

Answer 1

Предполагая, что пример, который вы предоставляете, отражает все ваши файлы, следующее должно помочь:

for f in *.1.dat
do
  cat ${f%%1.dat}* > ${f%%1.dat}1_3.dat
done

Для этого необходимо, чтобы каждая группа содержала файл с расширением .1.dat.

Answer 2

printf "%s\n" * | cut -d. -f1-3 | sort -u | while read prefix; do
  files=(${prefix}*)
  first=$(cut -d. -f4 <<< "${files[0]}")
  last=$(cut -d. -f4 <<< "${files[${#files[@]}-1]}")
  newfile=$(printf "../bondvalues/%s.%s_%s.dat" "$prefix" "$first" "$last")
  cat "${files[@]}" > "$newfile"
done