Вы должны попробовать rsync, чтобы отслеживать скорость передачи. Например:
rsync -PSauv sourcedir/* destdir/
Если вы на самом деле видите снижение скорости передачи, в отличие от файлов, которые просто большие, то вам нужно взглянуть на несколько других вещей.
Если ваш диск связан с вводом / выводом, у вас будут проблемы. Это часто наблюдается при интенсивной записи на флэш-диск или внешнее USB-устройство.
Протестируйте оба диска с помощью hdparm -Tt <device>
чтобы увидеть, является ли один значительно медленнее, чем должен быть, или значительно медленнее, чем другое устройство, что может привести к проблемам ввода-вывода.
Проверьте вывод dmesg и состояние SMART, чтобы убедиться в отсутствии явных ошибок на диске. Вы могли бы также рассмотреть badblocks -n
если вы подозреваете ошибки диска на диске не SMART.
Существует множество причин, по которым диск может работать со сбоями или работать неоптимально, но пока вы не сможете измерить проблему, вы не узнаете, в чем проблема. :)