Вам просто нужно уменьшить размер раздела до размера, который ниже вашего будущего диска, а затем использовать partimage/clonezilla для создания образа всего диска.
Восстановив его на меньшем диске, вы можете снова расширить раздел, если хотите точно установить диск.
Gparted поддерживает сжатие разделов, но вы должны убедиться, что ваша файловая система поддерживает это, а некоторые из них этого не делают: например, XFS и JFS.
Надеемся, что ext2/3/4, которые очень распространены, поддерживают это.
ReiserFS также можно сжать, но имейте в виду, что это может занять несколько часов, в зависимости от размера данных, перемещаемых в начало раздела.