Нашел это на другом сайте
Сверните все окна
Щелкните правой кнопкой мыши пустой раздел рабочего стола и выберите «Создать => Ярлык».
Введите это в открывшемся окне: taskkill.exe /IM skype.exe /T и нажмите Enter (или нажмите «Далее»)
Введите имя для ярлыка (мое обычное имя SkypeKill) и нажмите «Готово» (или нажмите Enter)
Прикрепите (перетащите) ярлык к панели задач, чтобы Skype можно было закрыть и закрыть одним щелчком мыши на значке этой панели задач.
Вот и все. Что это делает:
/IM изящно закрывает процесс с «именем изображения» skype.exe
/T закрывает все связанные процессы skype.exe открыт
Если Skype не закрывается изящно с этим (я видел его на некоторых компьютерах), я добавляю '/F' в конец команды taskkill, чтобы принудительно закрыть его: taskkill.exe /IM skype.exe /T /F