Сколько места используется? Если это не так много, это могут быть ваши лог-файлы.
Например, ваши /var /log /messages могут добавлять MARK каждые 20 минут или когда вы перезагружаетесь, добавляя загрузочную информацию, такую как отображение ОЗУ и регистрация различных драйверов и служб.
Я не уверен насчет Fedora, но большинство дистрибутивов стирают временный каталог при перезагрузке или хранят его в tmpfs.
Если это набор данных, вы можете использовать команду du, чтобы увидеть, где используется пространство. Вот быстрая команда для перечисления десяти лучших каталогов по размеру:
du -cks * | sort -rn | head -11
Если вы введете эту команду в каталоге /, она позволит вам работать с деревом, чтобы найти то, что потребляет ваше свободное пространство.
Пример: (вы, вероятно, хотите сделать это как root)
cwd # cd /
/ # du -cks * | sort -rn | head -11
du: cannot access `proc/8637/task/8637/fd/4': No such file or directory [don't worry bout these errors]
4252439 total
2462742 usr
506586 home
498021 var
[...]