У меня было это раньше. Однако я понял, что это вызвано не в Notepad++, а в другой части моего рабочего процесса. Я считаю, что место, где это происходит со мной, находится во время передачи файлов FTP. Я использую Filezilla.
Это может быть проблема с кодировкой через UTF-8/ANSI или другая проблема совместимости при передаче по FTP. Я замечаю, что это часто случается с файлами WordPress, включая файлы php .
Однако, опять же, проблема, скорее всего, не в notepad++, а в другой части рабочего процесса. Notepad++ просто открывает файл как есть.
Если вы уверены, что notepad++ вызвал его, попробуйте открыть его в обычном окне блокнота или просмотреть файл в веб-браузере файлов. Скорее всего, вы увидите, что именно так выглядит файл, и notepad++ не стал причиной проблемы.
Когда это происходит со мной, я исправляю это путем поиска / замены на \n\n > \n . Это просто берет каждую 2x new line и делает ее только одной new line . (\n обозначает new line). Убедитесь, что Extended проверен. Не всегда идеальное решение, но обычно делает свое дело.
Это не решает вашу исходную проблему, так как ваша первоначальная проблема не вызвана notepad++, но это более быстрый способ удаления лишних строк.

Надеюсь это поможет.