Да, точки доступа на одном и том же канале будут создавать помехи друг другу в том смысле, что, если они достаточно близки друг к другу, только один отправитель может использовать канал. Другая точка доступа (и другие станции в этом канале) обнаружат это и будут молчать для этого временного интервала (кадра). Таким образом, оба будут работать, но вы получите сокращение пропускной способности в воздухе, когда оба используются.
Так что выберите две точки доступа, которые находятся дальше друг от друга, и дайте те же каналы.
Автоматическое или ручное снижение мощности уменьшает этот вид помех, как и многочисленные антенны с формированием луча.
Если сомневаетесь, оцените: например, есть приложения для смартфонов, которые могут показать уровень сигнала всех точек доступа, которые ваш телефон в настоящее время может принимать.
Поскольку вся связь WLAN использует несколько каналов (4 или даже 8 для 802.11n с более высокой пропускной способностью), наличие двух точек доступа на канале 1 все же намного лучше, чем, скажем, наличие одной точки доступа на один канал 4. Эта точка доступа будет мешать обоим с AP на канале 1 и канале 6.
редактировать
Если вы хотите понять роль SSID: это просто информация в обычном широковещании ("маяк"), отправляемая AP, и поле данных в некоторых пакетах управления. Он позволяет клиенту WLAN выбирать точку доступа, с которой он хочет связаться, и помогает сортировать различные "сети" (например, вашу и соседа) на уровне протокола, но это все, что он делает.