Я использовал Windows 10 и Ubuntu на одном и том же компьютере с разных SSD, причем обе системы обращались к одним и тем же HDD, отформатированным в NTFS. На компьютере установлена материнская плата Asus z97. Я просто переустановил Windows, уничтожив старую установку, и на компьютере произошли следующие изменения:
В разделе загрузочного устройства настройки BIOS материнская плата не предлагает SSD с Ubuntu в качестве одного из загрузочных устройств, которые можно выбрать в качестве первого, второго и т.д. Загрузочного устройства, хотя этот SSD можно выбрать в качестве загрузочного устройства, когда загрузка прерывается вручную (клавиша F8).
Есть 3 жестких диска, отформатированных в NTFS, но Windows 10 обнаруживает только 2 из них, хотя все они использовались с Windows без проблем, прежде чем я переустановил его.
Ubuntu OS - это устаревшая версия BIOS, которая может иметь какое-то отношение к проблеме загрузки, но что-то еще приводит к тому, что Windows не может обнаружить все жесткие диски. После того, как я заметил эти проблемы, я восстановил настройки по умолчанию в настройках BIOS, но это не помогло с проблемами.