У меня есть CSV-файл, который имеет 7 столбцов. В нем есть пустые ячейки и несколько пробелов между ячейками. Как я могу заменить пустые ячейки на NA и удалить лишние пробелы? Большое спасибо!
Вот как выглядит мой файл, но здесь, кажется, он искажается, когда я копирую его и пропускаю.
130070078,PPW0001,1,4,4HW ,2,15.61943874
120040039,PPW0002,0,0, ,0,0
120040043,PPW0003,1,3,3WE ,1,14.43394935
Использование sed которое будет работать и для повторяющихся пустых полей:
sed ':l;s/,,/,NA,/;tl; s/[[:blank:]]*//g'
Или используя awk:
awk '{i=0;while(i++<2){gsub(/,,/,",na,");gsub(/ /, "")}}1'
Входные данные:
130070078,PPW0001,1,4,4HW ,2,15.61943874 120040039,PPW0002,0,0, ,0,0 120040043,PPW0003,1,3, 3WE ,1,14.43394935 120040043,PPW0003,1 ,3,3WE ,1,14.43,,,3,,94,,,,9,,,,,35 120040043,PPW0003,0, 2, 3WE ,1,14.43,,,3,,94,,,,9,,,,,35
Выход:
130070078,PPW0001,1,4,4HW,2,15.61943874 120040039,PPW0002,0,0,,0,0 120040043,PPW0003,1,3,3WE,1,14.43394935 120040043,PPW0003,1,3,3WE,1,14.43,NA,NA,3,NA,94,NA,NA,NA,9,NA,NA,NA,NA,35 120040043,PPW0003,0,2,3WE,1,14.43,NA,NA,3,NA,94,NA,NA,NA,9,NA,NA,NA,NA,35
Ответ αғsнιη работал для меня, но я просто хотел бы немного его объяснить.
Я пытался что-то вроде этого:
echo "1,,2,,,3,,,4,,,,5,,,,,,,,,,6" | sed 's/,,/,-,/g'
Какие выводы
1,-,2,-,,3,-,,4,-,,-,5,-,,-,,-,,-,,-,6
Из-за повторяющихся пустых полей последняя запятая является частью первой замены и началом следующей требуемой замены, поэтому вы просто заменяете каждое второе пустое поле.
Теперь вы можете сделать что-то вроде:
echo "1,,2,,,3,,,4,,,,5,,,,,,,,,,6" | sed -e 's/,,/,-,/g' -e 's/,,/,-,/g'
или же
sed 's/,,/,-,/g;s/,,/,-,/g'
Который заменит все ячейки, поскольку вторая команда получит те, которые пропущены, но это немного грязно.
Команда αғsнιη делает по существу то же самое, используя метку и прыжок, чего я не знал, что вы могли бы сделать.
sed ':MYLABEL; s/,,/,-,/g; t MYLABEL;'
выход:
1,-,2,-,-,3,-,-,4,-,-,-,5,-,-,-,-,-,-,-,-,-,6
Итак, первая часть команды создает метку.
Тогда у нас такая же замена.
Затем у нас есть команда t, которая означает переход к метке, если предыдущая команда замещения была успешной.
Дополнительная информация: http://www.grymoire.com/Unix/Sed.html#uh-59.
Ваш ответ:
sed 's/ *,/,/g' file1 | sed 's/,,/,NA,/g' > file2
Чтобы получить 'NA' в последнем поле, если пусто:
sed 's/ *,/,/g' file1 | sed 's/,,/,NA,/g' | awk -F, 'OFS="," {if ($NF == "") $NF = "NA"; print}'> file2
Вы также можете использовать:
sed 's/,,/,NA,/g' file1 | tr -d ' ' | awk -F, 'OFS="," {if ($NF == "") $NF = "NA"; print}'