Я в университетском кластере, нет су для меня. Я пытаюсь заставить Кераса работать, с тензорным потоком или теано. Сбой Tensorflow, потому что система имеет только CUDA 7.5. У него есть чипсет Intel, но он доставляет мне проблемы с математикой.
Изменить: После некоторого взлома, я решил скомпилировать Python 3.5 из исходного кода. И вот:
gcc -pthread -c -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -Werror=declaration-after-statement -I. -I./Include -DPy_BUILD_CORE -o Programs/python.o ./Programs/python.c
In file included from ./Include/pyport.h:328:0,
from ./Include/Python.h:50,
from ./Programs/python.c:3:
/cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/math.h:29:3: error: #error "This Intel <math.h> is for use with only the Intel compilers!"
# error "This Intel <math.h> is for use with only the Intel compilers!"
^
make: *** [Programs/python.o] Error 1
Та же проблема с math.h!
Похоже, что это основная проблема в ошибке установки Theano.
VV --- Это был мой оригинальный пост --- VV
Theano, выдает эту ошибку при import theano:
с последующим
Problem occurred during compilation with the command line below:
/gpfs/software/gcc-4.9.2/bin/g++ -shared -g -march=haswell -mmmx -mno-3dnow -msse -msse2 -msse3 -mssse3 -mno-sse4a -mcx16 -msahf -mmovbe -maes -mno-sha -mpclmul -mpopcnt -mabm -mno-lwp -mfma -mno-fma4 -mno-xop -mbmi -mbmi2 -mno-tbm -mavx -mavx2 -msse4.2 -msse4.1 -mlzcnt -mno-rtm -mno-hle -mrdrnd -mf16c -mfsgsbase -mno-rdseed -mno-prfchw -mno-adx -mfxsr -mxsave -mxsaveopt -mno-avx512f -mno-avx512er -mno-avx512cd -mno-avx512pf -mno-prefetchwt1 --param l1-cache-size=32 --param l1-cache-line-size=64 --param l2-cache-size=15360 -mtune=generic -DNPY_NO_DEPRECATED_API=NPY_1_7_API_VERSION -m64 -fPIC -I/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/numpy/core/include -I/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m -I/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/gof -fvisibility=hidden -o /gpfs/home/USERNAME/.theano/compiledir_Linux-2.6-el6.x86_64-x86_64-with-centos-6.6-Final-x86_64-3.5.2-64/lazylinker_ext/lazylinker_ext.so /gpfs/home/USERNAME/.theano/compiledir_Linux-2.6-el6.x86_64-x86_64-with-centos-6.6-Final-x86_64-3.5.2-64/lazylinker_ext/mod.cpp -L/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib -lpython3.5m
In file included from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/pyport.h:13:0,
from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/Python.h:50,
from /gpfs/home/USERNAME/.theano/compiledir_Linux-2.6-el6.x86_64-x86_64-with-centos-6.6-Final-x86_64-3.5.2-64/lazylinker_ext/mod.cpp:1:
/cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/stdint.h:79:10: warning: undefining "__STDC_LIMIT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG"
# undef __STDC_LIMIT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG
^
/cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/stdint.h:83:10: warning: undefining "__STDC_CONSTANT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG"
# undef __STDC_CONSTANT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG
^
In file included from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/pyport.h:328:0,
from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/Python.h:50,
from /gpfs/home/USERNAME/.theano/compiledir_Linux-2.6-el6.x86_64-x86_64-with-centos-6.6-Final-x86_64-3.5.2-64/lazylinker_ext/mod.cpp:1:
/cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/math.h:29:3: error: #error "This Intel <math.h> is for use with only the Intel compilers!"
# error "This Intel <math.h> is for use with only the Intel compilers!"
^
Traceback (most recent call last):
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/gof/lazylinker_c.py", line 74, in <module>
raise ImportError()
ImportError
During handling of the above exception, another exception occurred:
Traceback (most recent call last):
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/gof/lazylinker_c.py", line 91, in <module>
raise ImportError()
ImportError
During handling of the above exception, another exception occurred:
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/__init__.py", line 63, in <module>
from theano.compile import (
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/compile/__init__.py", line 9, in <module>
from theano.compile.function_module import *
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/compile/function_module.py", line 22, in <module>
import theano.compile.mode
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/compile/mode.py", line 12, in <module>
import theano.gof.vm
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/gof/vm.py", line 638, in <module>
from . import lazylinker_c
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/gof/lazylinker_c.py", line 126, in <module>
preargs=args)
File "/gpfs/home/USERNAME/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/theano/gof/cmodule.py", line 2204, in compile_str
(status, compile_stderr.replace('\n', '. ')))
Exception: Compilation failed (return status=1): In file included from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/pyport.h:13:0,. from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/Python.h:50,. from /gpfs/home/USERNAME/.theano/compiledir_Linux-2.6-el6.x86_64-x86_64-with-centos-6.6-Final-x86_64-3.5.2-64/lazylinker_ext/mod.cpp:1:. /cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/stdint.h:79:10: warning: undefining "__STDC_LIMIT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG". # undef __STDC_LIMIT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG. ^. /cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/stdint.h:83:10: warning: undefining "__STDC_CONSTANT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG". # undef __STDC_CONSTANT_MACROS_DEFINED_BY_CLANG. ^. In file included from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/pyport.h:328:0,. from /gpfs/home/USERNAME/anaconda3/include/python3.5m/Python.h:50,. from /gpfs/home/USERNAME/.theano/compiledir_Linux-2.6-el6.x86_64-x86_64-with-centos-6.6-Final-x86_64-3.5.2-64/lazylinker_ext/mod.cpp:1:. /cm/shared/apps/intel/compilers_and_libraries/2016.2.181/compiler/include/math.h:29:3: error: #error "This Intel <math.h> is for use with only the Intel compilers!". # error "This Intel <math.h> is for use with only the Intel compilers!". ^.
Theano был установлен вместе с conda install theano .
Я не совсем уверен, что такое глупость, но я подозреваю, что недостаток python-dev может быть в игре.
Системная информация:
Конда 4.3.13
Python 3.5.2 | Continuum Analytics, Inc. | (по умолчанию, 2 июля 2016 г., 17:53:06) [GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-1)] в linux Для получения дополнительной информации введите "помощь", "авторское право", "кредиты" или "лицензия" ,
lsb_release -a:
LSB версия::base-4.0-amd64:base-4.0-noarch:core-4.0-amd64:core-4.0-noarch:graphics-4.0-amd64:graphics-4.0-noarch: печать-4.0-amd64: печать-4.0- noarch
Идентификатор дистрибьютора: CentOS
Описание: CentOS выпуск 6.6 (финальный)
Релиз: 6.6
Кодовое имя: Финал
uname -r: 2.6.32-504.16.2.el6.x86_64
Изменить: список вещей, которые я пробовал:
- Обновление до 0.9: deeplearning.net/software/theano/install.html#bleeding-edge-install-instructions (глупое ограничение репутации ссылки!)- та же ошибка
- Добавлен ~/anaconda3 в
LD_LIBRARY_PATH
Моя интуиция заключается в том, что он не находит что-то, на что он должен ссылаться, но я не могу точно определить, что или как это исправить.