Таким образом, у вас есть два жестких диска, оба имеют независимые и загружаемые операционные системы при индивидуальном подключении?
Ответ здесь заключается в том, чтобы использовать вашу системную утилиту BIOS/UEFI, точные детали которой могут сильно различаться в зависимости от производителя и реализации, но обычно применяется один или оба из этих методов:
1) Выбор по требованию - на большинстве компьютеров есть способ выбора загрузочного устройства при каждом запуске, часто называемый "меню загрузки" или чем-то подобным, точная комбинация клавиш для вызова этого меню варьируется, но часто это ESC, F2, F9, F10 или аналогичный. Это должно вызвать утилиту или загрузочное меню, позволяющее выбрать диск для загрузки. Это однократная настройка, и при следующем запуске она вернется к значению по умолчанию.
2) Изменение порядка приоритета загрузки BIOS - это делается в настройках BIOS/UEFI компьютера, опять же, это зависит от производителя, но должен быть пункт меню порядка загрузки, позволяющий выбрать устройства для загрузки в каком порядке. Вы должны изменить это на порядок, который вы хотите, например:
1) Оптический привод
2) Съемный USB-накопитель
3) HDD 0
4) HDD 1
5) Сеть
и вы просто измените заказ в соответствии с вашими потребностями. Он будет искать загрузочное устройство, начиная сверху и спускаясь по списку, вы меняете этот порядок по мере необходимости. Это постоянно и переживает перезагрузку.
Всего несколько ссылок ... буквально сотни доступны в Google с помощью поиска "изменить порядок загрузки" или "выбрать загрузочное устройство" или аналогичных терминов. Вы можете еще более сузить его, добавив свою модель ПК, например, "Asus m5a97 select boot device".
http://www.boot-disk.com/boot_priority.htm
http://www.howtogeek.com/129815/beginner-geek-how-to-change-the-boot-order-in-your-computers-bios/
https://www.lifewire.com/change-the-boot-order-in-bios-2624528