У них точно такие же файлы .ssh и разрешения, и они «ssh» в одной и той же локали (на самом деле git fetch)
Вот окно Linux:OpenSSH_5.3p1, OpenSSL 1.0.1e-fips 11 февраля 2013
debug3: sign_and_send_pubkey: RSA 2a:7d:aa:b0:bd:c7:7e:98:6c:71:1b:cf:7b:27:e4:c8:28:2d:7c:1c
debug2: we sent a publickey packet, wait for reply
debug3: Wrote 656 bytes for a total of 1965
debug1: Authentications that can continue: keyboard-interactive,publickey
..
вот Cygwin: OpenSSH_7.1p2, OpenSSL 1.0.2h 3 мая 2016
debug3: sign_and_send_pubkey: RSA MD5:b4:22:b7:ca:60:69:dc:f0:d8:42:18:ed:61:6c:08:70
debug2: we sent a publickey packet, wait for reply
debug1: Authentication succeeded (publickey).
..