Я не могу сказать вам, здоров ли ваш SSD или нет, поэтому я не могу судить, должно ли удаление мешка с крошечными файлами быть таким долгим.
Однако фактом является то, что копирование и / или даже удаление 4G небольших файлов занимает на несколько порядков дольше, чем 4G, содержащее только пару из них.
Во время этих действий ОС должна обновлять / удалять метаданные в дополнение к блокам файлов. Если индексация разрешена, даже данные индекса должны быть затронуты. Когда вы манипулируете относительно большими файлами, вы не понимаете, сколько времени занимает администрирование содержимого файловой системы, но когда разница между временем записи мета и реальных данных невелика, большой объем может сделать даже сильный Человек плачет.
Проверять работоспособность вашего диска не повредит, но как только вы снова будете в бизнесе, я рекомендую отключить индексацию там, где это действительно не требуется, и создать пакет (zip, rar, любой) файлов и регулярно их удалять, если они не должен быть онлайн постоянно.