Откройте свой терминал и введите текст ниже
nano /etc/apt/sources.list
После этого вы очищаете текстовый файл вставки
#deb cdrom:[Debian GNU/Linux 7.0 _Kali_ - Official Snapshot amd64 LIVE/INSTALL Binary 20141002-11:29]/ kali contrib main non-free
#deb cdrom:[Debian GNU/Linux 7.0 _Kali_ - Official Snapshot amd64 LIVE/INSTALL Binary 20141002-11:29]/ kali contrib main non-free
deb http://http.kali.org/kali kali main non-free contrib
deb-src http://http.kali.org/kali kali main non-free contrib
## Security updates
deb http://security.kali.org/kali-security kali/updates main contrib non-free
После этого вы сохраняете файл и выходите.
Затем введите в терминале
apt-get update && apt-get update
Если не получится, попробуйте два или три раза. Помните, что не используйте сторонние репозитории.