Файлы, оканчивающиеся на tilda ~, обычно являются временными файлами, вероятно, оставленными каким-либо редактором. Так что это зависит от программного обеспечения
Файлы начинаются с точки. скрытые файлы по дизайну UNIX (и Linux).
Цель временных файлов - предоставить вам резервную копию на случай сбоя вашего редактора, который может поставить отредактированный файл в непредсказуемое состояние. Если вы уверены в состоянии редактируемого файла, вы можете сохранить удаленные временные файлы.
Назначение скрытых файлов (очевидно) - скрыть некоторые файлы от «первого / быстрого» просмотра файлов в определенном каталоге. Обычно они сохраняют некоторые конфигурации. То же самое (точка как первый символ в имени) верно для каталогов. Обычно не стоит прикасаться к скрытым файлам, кроме тех случаев, когда вы знаете, чего именно хотите достичь