Chrome использует настройки прокси для вашей DE. Если вы используете KDE, он будет использовать это. Если вы используете Gnome, он будет использовать их. Если вы тоже не используете, я думаю, что он попытается использовать Gnome, но не уверен на 100%.
Если вы зайдете в гаечный ключ -> Под капотом, у вас должна быть кнопка в разделе Сеть с пометкой Изменить настройки прокси. Когда я нажимаю эту кнопку, в моем случае загружаются настройки KDE Proxy.
Если вы не используете ни KDE, ни Gnome, вы можете попробовать просмотреть gconf, Chrome использует его для хранения настроек.