Нет ничего волшебного в том, установлен ли жесткий диск внутри или с помощью внешнего корпуса.
Фактически, большинство жестких дисков, используемых сегодня в бытовом оборудовании, используют интерфейс SATA, который имеет специально указанного внешнего двоюродного брата, а именно eSATA.
USB Mass Storage предоставляет аналогичные услуги.
Очевидно, что операционная система должна поддерживать соответствующий интерфейс подключения, но любая современная операционная система будет отлично поддерживать запоминающие устройства с подключением как eSATA, так и USB. В Windows 8.1 не должно быть проблем ни с одним из них.
Права доступа к файлам не будут зависеть от различных интерфейсов вложений, как к лучшему, так и к худшему.
Если вы обычно запускаете Windows с внутреннего диска, перемещаете этот диск во внешний корпус и загружаетесь с новой установки на новый внутренний диск, и у вас нет централизованно управляемых учетных данных для входа (например, через Active Directory), тогда Учетная запись пользователя в новой установке Windows будет иметь другой идентификатор безопасности. Поскольку разрешения привязаны к идентификатору безопасности, это может создать проблему, даже если вы называете учетную запись одинаково. Если вы используете шифрование NTFS, доступ к этим файлам будет невозможен.
Обычный способ сделать то, что вам нужно, это перенести файлы со старого диска, когда он используется, как обычно, на новый диск (который может быть подключен извне, в зависимости от обстоятельств). Тем не менее, нет технической причины, по которой вы не можете сделать это наоборот. Просто убедитесь, что сначала полностью отключили шифрование NTFS для всего, что вы хотите передать.