Вам нужно исправить загрузочную запись.
Вообще grub (и почти все загрузчики) состоят из 2 частей. Первый очень маленький и расположен на одном из первых секторов вашего диска (физических секторов), другой немного больше и находится в разделе.
Первая часть умудряется каким-то образом смонтировать вторую и руки к ней.
Поскольку вы уничтожили эту вторую часть, она понятия не имеет, что делать, и бросает вас на помощь.
Правильный способ исправить это состоит в том, чтобы каким-то образом загрузиться с носителя для восстановления Windows (желательно той версии, которая у вас есть, хотя другие могут работать) и исправить MBR. Команда является fixmbr.
Другой альтернативой является установка другого linux для grub.
Еще одно - использовать supergrub на флешке.
И еще один ... в подсказке grub rescue:
root (hd0,X)
makeactive
chainloader +1
X - количество установленных окон разделов (если первое 0, если второе 1 и т.д.)
ПРИМЕЧАНИЕ. Это не исправит ваш загрузочный сектор, но позволит вам запускать окна и ничего более.