Мне трудно понять эту терминологию.
Что именно подразумевается под сервером приложений? Мне кажется, что это веб-сервер с дополнительными возможностями сценариев, как AMP-сервер или Apache + JSP.
Когда я смотрю на документацию, например, JBoss или Zend, похоже, что он запускает сервлет / скрипт только при получении http-запроса. То же, что и php-интерпретатор в настройке AMP. И сетевой трафик тоже только через http-запросы.
Разница, которую я заметил, заключается в том, что серверы приложений лучше контролируют запущенные в данный момент скрипты / сервлеты.