В мультизагрузочной системе с потенциально установленным загрузчиком на каждую ОС, как BIOS знает, какой загрузчик передать управление? Как указано, какой загрузчик является активным?
Давайте возьмем несколько установок Linux, например. Я предполагаю, что вы можете указать новый и уникальный раздел (или жесткие диски) для /boot, который будет монтироваться для каждого Linux, который вы решили установить. Это оставит один загрузчик на ОС, я полагаю.