Вы можете смонтировать каждый контейнер TC, а затем использовать robocopy, встроенный инструмент командной строки, для копирования измененных файлов. Используйте ключ командной строки /MIR для создания идентичной копии, включая удаление файлов на цели, которые были удалены из источника.
В bacth-файле вы можете смонтировать оба тома truecrypt, а затем использовать robocopy для передачи измененных файлов.
rem mount source as s:, target at t:
TrueCrypt.exe /v e:\source.tc /ls /q /c
TrueCrypt.exe /v f:\target.tc /lt /q /c
rem copy the files
robocopy.exe s:\ t:\ * /mir
rem dismount TC volumes
TrueCrypt.exe /d s:
TrueCrypt.exe /d t: