Предполагается, что это система Windows 7.
Если UAC (Контроль доступа пользователей) включен как минимум на рекомендованном уровне (Панель управления-> Учетные записи пользователей -> Изменить настройки UAC ...Уровень по умолчанию), то, что происходит, так это то, что по умолчанию при входе в Windows вы не работаете как "Полный" Администратор. Вот почему вы время от времени получаете подсказки о том, хотите ли вы запускать что-то от имени администратора.
Таким образом, если вы запускаете какую-то программу, а затем она запрашивает подтверждение, то только после этого программа работает с привилегиями полной безопасности.
Чтобы заставить программу работать от имени определенного пользователя или обладать особыми привилегиями, ознакомьтесь с инструментарием Microsoft Application Compatibility Toolkit. Вы можете выбрать, какое приложение и какое «Исправить» применить. Это избавит вас от путаницы с ярлыками и рунами в цели.
Вот еще пара идей: neowin.net. Заметил, что один из запланированных заданий, довольно изящная идея.
Но если ваше главное беспокойство связано с безопасностью, увеличьте UAC до «Всегда уведомлять». Вы также можете посмотреть на Песочницы для приложений, такие как Песочница.