Суперблок mdadm размещается ближе к концу устройства / раздела, чем к началу. Вот почему он все еще определялся как устройство RAID (Windows просто еще не записывала данные так далеко на устройство). Кроме того, если mdadm все еще может читать суперблок, я думаю, что было бы безопасно предположить, что Windows / NTFS по-прежнему считает эту область устройства "пустой", и поэтому не думает, что там есть что-то, что имеет значение. Это означает, что это должно быть безопасно обнулить его.
Раньше по той же причине мне приходилось обнулять суперблок на устройствах, содержащих другие файловые системы linux, и он никогда не вызывал проблем и не повредил файловую систему.
ОТКАЗ ОТ ОТВЕТСТВЕННОСТИ: Я не знаю достаточно о том, что содержится в суперблоке, чтобы точно сказать, что он всегда будет поврежден до такой степени, что его невозможно будет прочитать, если Windows коснется его, поэтому используйте этот совет на свой страх и риск. Просто качка в том, что знания у меня есть. Рад, что это сработало для вас!